1、熟练使用R语言,熟悉python,和Linux常用命令,运用office等常用的办公软件
2、熟练掌握生物信息分析及编程知识,熟悉单细胞组学、表观基因组学、遗传易感性、肿瘤多组学等研究的数据分析方案,了解GEO等多种生物信息数据库。
3、熟悉单细胞数据分析流程。
4、DNA甲基化芯片基础分析及个性化服务流程。
5、基于GEO数据库的肿瘤数据的单细胞流程分析。
6、肿瘤变异位点识别流程搭建。
毕业项目是以单细胞转录组技术解析近视形成过程中巩膜异质性变化特征,熟悉单细胞数据分析流程。
实习:DNA甲基化报告系统开发:基于R的DNA甲基化芯片基础分析及报告系统。
实习:基于GEO数据库的肿瘤药物靶点发现:基于GEO数据库,利用python和R进行单细胞分析发现肿瘤药物靶点。
工作:
1、背景降噪系统研发(基于UMI处理):基于UMI处理,从不同角度比较sentieon和fgbio处理的效果,挑选合适的工具为后续的变异检测做准备。
2、高通量测序性能评价:根据不同的性能参数,挑选适合人和微生物的测序平台。
3. MSI检测流程开发: 研究内容是调研MSI相关信息,根据市场产品参数制定标准,筛选工具算法并进行对比,利用模拟数据搭建开发流程。
以上项目都是个人独立完成。
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