气相色谱质谱联用分析系统 远程全职
一般月薪60000元- 项目类型:
- 每月工作: 30天
- 工作方式:远程
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本软件旨在进行气相色谱质谱数据的处理和基本的统计分析,为全谱定性代谢组学研究提供一站式的分析平台。
1. 对于原始GC-MS数据,提供去噪、平滑和基线校正方法各2种以上。
2. 提供3种峰识别方法:centWave(R的XCMS包新版本)、matchedFilter(R的XCMS包旧版本)、前两种方法结合(ADAP 3.0的方法)。
3. 提供3种解卷积方法,分别来自以下软件的相应的部分:Chromatof(有LECO公司提供的word文档)、AMDIS(有NIST的文献,free)和H-MCR(有旧版本的matlab source code和文献以及改进版的文献)。相应网站均有详细介绍。
4. 提供2种峰对齐方法,分别来自以下软件工具相应的部分:XCMS(R包)和MZmine2(Java,free)。提供分段(自动分和人工分)和整体两种对齐方式。参考图谱可自动选择也支持用户指定。相应网站均有详细介绍。有的方法是先对齐再提峰,有的方法是先提峰再对齐。
5. 由于算法的不同,峰识别、解卷积和峰对齐几步的顺序不固定,也不是都必须采用的步骤。提供EIC和TIC两种峰面积提取方法,提供3种以上积分方法。
采用Java和R联合开发。(了解气相色谱、有过色谱数据模型开发的优先)